Новый метод идентификации сортов оливок

По словам Константиноса Блазакиса, исследователя, работающего с Панайотис Калаитцис в отделе садовой генетики и биотехнологии Средиземноморского агрономического института Ханьи (MAICh) на Крите, Греция.

Блазакис надеется, что одним из применений этого нового метода станет приложение для мобильного телефона, которое сможет идентифицировать сорт на основе фотографии оливкового плода, листа или эндокарпа. Он рассчитывает начать работу с греческими сортами в течение следующего года или двух и надеется заручиться поддержкой, чтобы позже добавить международные сорта в это приложение в качестве дополнительного проекта. Он признает, что приложение для мобильного телефона, вероятно, будет наиболее полезным в странах, где есть много разных сортов оливок, поскольку фермеры хотят быть уверены, что знают, какой сорт у них есть.

Еще одна цель Блазакиса — внести свой вклад в новую международную онлайн-базу данных, которая будет каталогизировать информацию о внешнем виде и химическом анализе, среди прочего, сортов оливок во всем мире. Он сказал, что пятнадцать партнеров из ряда стран работают вместе, чтобы подготовить эту удобную базу данных для широкой публики, которая будет на основе генетического, физиологического, молекулярного и морфологического изучения каждого сорта». Исследователи намерены включить предыдущие данные, дважды проверенные на точность, а также добавить новую информацию.

Это часть широкомасштабного и амбициозного проекта «Биоресурсы для оливкультуры», или BeFOre, который получил финансирование от Европейского Союза. Horizon 2020 исследовательская и инновационная программа в рамках соглашения о гранте Марии Склодовской-Кюри, а также поддерживается Международным советом по оливкам.

Перед сосредоточены на создании интегрированных общих протоколов для фенотипа и характеристики растений на молекулярном, морфологическом и физиологическом уровне, а также на оценке качества оливкового масла, связанного с сортами», — говорится в сообщении. Веб-сайт, рассчитывая улучшить потенциал коллекций, хранилищ и банков зародышевой плазмы оливок как основных источников изменчивости и инструментов оценки, которые будут использоваться для повышения устойчивости оливкового хозяйства и решения существующих и возникающих проблем».

Подчеркивая важность оценки и характеристики разнообразия видов оливок для сохранения богатого разнообразия генетических ресурсов со всеми их преимуществами для здоровья, Блазакис уделяет особое внимание форме и структуре, или морфологии оливок, оливковых деревьев и их листьев.

В 3^rd На Международном симпозиуме по садоводству в Европе в Ханье, Крит, в середине октября Блазакис представил работу, которую он делает в сотрудничестве с Лучианой Бальдони и Мариной Буфакки из Итальянского национального исследовательского совета, Абдельмаджидом Мухли из INRA Марракеш в Марокко и Панайотисом Калаитцисом из MAICh. (который является частью Международного центра передовых средиземноморских агрономических исследований).

В презентации под названием Усовершенствованные математические алгоритмы для характеристики сортов оливок с помощью морфологических параметров», — пояснил Блазакис. исследование направлено на то, чтобы представить совершенно новую полуавтоматическую методологию для определения различных морфологических параметров различных сортов оливок. Его метод включает 5 шагов:

• собрать образцы листьев и плодов: 25 или 30 из середины дерева, сорт которого был определен в питомнике
• создавать данные изображения: фотографировать их
• сегментация: отделить изображение листьев, оливок или семян от фона с помощью научного программного обеспечения
• применять математические алгоритмы: использовать программное обеспечение MATLAB для создания набора инструкций, связанных с различными аспектами формы и структуры оливки или листа, например, (для плода) площадь, периметр, высота, максимальная ширина, положение максимальной ширины, симметрия или отсутствие симметрии, форма эллипса, кривизна, ниппель
• перевести результаты: получить числа, описывающие каждый аспект формы и структуры каждого сорта оливок

Блазакис упомянул, что необходимо провести дополнительные тесты, чтобы убедиться, что морфологические параметры, с которыми работает его команда, могут различать разные сорта, но он считает, что они добьются успеха. Он добавил, что разрабатываемый им автоматический инструмент обеспечит более быстрый и менее дорогой метод определения сорта оливок, чем анализ ДНК, и предоставит полезную возможность многим фермерам, которые ищут информацию о своих деревьях.

• Биоресурсы для оливководства, или Описание проекта BeFOre


• III Международный симпозиум по садоводству в Европе — SHE2016